تا به امروز، هیچ روش مکانیزه ای برای برداشت ایمن محصول گل زعفران ارائه نشده است. از آنجا که نخ ها بسیار ظریف هستند، باید تک تک آنها به آرامی و ملایمت با دست برداشته شوند. پس از جدا شدن از گل، به صورت تخصصی خشک می شوند تا رنگ قرمز طبیعی و طعم بی نظیر خود را حفظ کنند و از جذب رطوبت در هنگام بسته بندی در امان باشند.
گلها نیز کوچک هستند و بسیار نزدیک به زمین رشد می کنند، این حالت باعث می شود در حین برداشت، گل ها در معرض له شدگی و فشرده شدن قرار بگیرند. مسأله سالم ماندن محصول باید در بسته بندی زعفران صادراتی نیز رعایت شود.